Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SORCS2Q96PQ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms