Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OPALINQ96PE5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms