Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF4Q96M43 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms