Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms