Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUB2Q96DC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms