Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDAC11Q96DB2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms