Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4CQ96CF2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms