Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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