Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCAMP4Q969E2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms