Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FRAT1Q92837 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRAT1Q92837 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms