Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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PTPRUQ92729 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRUQ92729 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRUQ92729 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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