Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms