Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms