Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOPBP1Q92547 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPBP1Q92547 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms