Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCSTNQ92542 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms