Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PYDC1Q8WXC3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms