Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMER3Q8N944 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMER3Q8N944 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms