Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms