Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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