Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms