Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF3Q7Z739 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF3Q7Z739 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms