Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms