Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms