Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUFY3Q7L099 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms