Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
HECW1Q76N89 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HECW1Q76N89 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HECW1Q76N89 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HECW1Q76N89 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HECW1Q76N89 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms