Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDZD4Q76G19 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDZD4Q76G19 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms