Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNE3Q6ZMZ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms