Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms