Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC174Q6PII3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms