Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms