Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM29Q5VYK3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms