Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGSNQ5TDP6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms