Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms