Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN4Q5BKX8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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