Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms