Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms