Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms