Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP100Q494V2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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