Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms