Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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