Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB1Q16531 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB1Q16531 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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