Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS72Q15906 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS72Q15906 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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