Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA2Q15822 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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