Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms