Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms