Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIV2LQ15477 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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