Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHPRHQ149N8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHPRHQ149N8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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