Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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COL4A6Q14031 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms