Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CKAP5Q14008 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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CKAP5Q14008 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CKAP5Q14008 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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