Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK13Q14004 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK13Q14004 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK13Q14004 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK13Q14004 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
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